Satu milenium telah berlalu sejak perang nuklir dahsyat yang dinamai “Tujuh Hari Api”, yang menghancurkan hampir semua kehidupan di Bumi. Umat manusia sekarang hidup dalam perjuangan terus-menerus melawan hutan berbahaya yang telah berevolusi sebagai respons terhadap kehancuran yang disebabkan oleh manusia. Dipenuhi dengan spora beracun dan serangga yang sangat besar, hutan tersebut menyebar dengan cepat ke seluruh penjuru Bumi dan mengancam untuk menelan sisa-sisa umat manusia.
Jauh dari hutan, terdapat sebuah kerajaan pertanian yang damai yang dikenal sebagai “Lembah Angin”, yang letaknya di tepi laut membebaskannya dari penyebaran racun hutan yang mematikan. Putri muda yang karismatik di Lembah ini, Nausicaä, mendapati kerajaannya yang damai terganggu ketika sebuah pesawat dari kerajaan Tolmekia jatuh dengan keras di Lembah ini. Setelah Nausicaä dan penduduk Lembah menemukan benda berdenyut menyeramkan di reruntuhan pesawat, Lembah tiba-tiba diserbu oleh militer Tolmekia, yang berniat menghidupkan kembali senjata berbahaya dari Tujuh Hari Api. Sekarang Nausicaä harus berjuang untuk menghentikan Tolmekian dari menjerumuskan Bumi ke dalam bencana yang tidak akan pernah bisa diselamatkan oleh umat manusia, sekaligus melindungi Lembah dari kekuatan perambahan hutan beracun.
